光亲和探针与靶蛋白初步结合后,通过紫外光照射引发不可逆交联,在活细胞中共价捕获微弱/瞬时相互作用蛋白,并可通过后续点击化学反应进行荧光或质谱检测。
√能将探针-靶蛋白之间瞬时、微弱的相互作用稳定固化。
√显著提高相互作用检测的灵敏度和特异性,尤其适用于低丰度或弱结合靶点。

项目简介:在新药筛选过程中,基于细胞活力筛选技术,发现化合物A对目标细胞有显著抑制作用,为了从分子层面深入鉴定其靶点蛋白质及解析机制,并发掘潜在新靶标。我司针对化合物A的结构和活性特性,设计合成光亲和探针Probe A(含光交联与生物正交基团)。利用化学蛋白质组学技术平台,在活性相关的细胞系中运用荧光标记法和质谱技术进行靶点蛋白鉴定。结合生物信息学分析手段,深入探究化合物A的作用机制及其相关的新靶标蛋白。
数据展示:基于荧光胶分析的标记实验,Probe A能够有效标记蛋白质,且标记信号能够被化合物A显著竞争,表明Probe A与化合物A靶点覆盖度类似,能够用做化学探针工具,进行后续靶点发现。
Volcano plot 展示Probe A vs DMSO (Direct)实验中,114个蛋白质(上图红色标注)被Probe A探针显著性富集; Probe A vs (A+Probe A) (Competition) 实验中, 38个蛋白质(下图红色标注)被Probe A标记且被原始化合物A显著性竞争;两组实验产生32个高置信度A结合蛋白质。(n = 3, ratio ≥2,p-value ≤ 0.05 )。对32个高置信度A结合蛋白质进行GO_Biological pathway分析,候选蛋白质显著富集在phospholipid efflux, negative regulation of lipase activity, regulation of sterol transport等信号通路中,与表型吻合。
※以天然胆酸分子结构为基础,设计了一系列可以模拟其生物学功能的光交联胆酸分子探针,在活细胞水平上全面探寻了哺乳动物体内可以和胆酸分子特异性结合的潜在蛋白靶点,并从生化水平上进行了验证。本研究为北京大学王初教授(ju11net九州体育生物首席科学家、联合创始人)课题组合作工作。Chemoproteomic Profiling of Bile Acid Interacting Proteins.ACS Cent Sci.2017;3(5):501–509.(IF:13.1)
※利用多个光交联探针,在活细胞水平系统性解析天然产物醉茄素A的共价和非共价作用靶点网络。本文通讯作者之一胡昊博士现任ju11net九州体育生物研发总监。Chemoproteomics reveals proteome-wide covalent and non-covalent targets of withaferin A. Acta Pharmacol Sin. 2025 ;46(6):1782-1793.(IF: .8.4)
※合成与天然黄芩苷具有相似生物活性的光交联分子探针,并利用定量化学蛋白质组学技术来寻找黄芩苷在细胞内的直接药效靶点。本研究出自北京大学王初教授(ju11net九州体育生物首席科学家、联合创始人)课题组。Chemoproteomics reveals baicalin activates hepatic CPT1 to ameliorate diet-induced obesity and hepatic steatosis.Proc Natl Acad Sci U S A. 2018;115(26):E5896-E5905.(IF:9.1)