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技术平台

ChomiXDegrade™ 是一个基于 TMT/DIA 多重定量蛋白质组学 的技术平台,其核心能力是提供深度覆盖(单细胞系定量蛋白超 8,000 种)和精准定量蛋白质丰度变化。它旨在全景式地量化靶向蛋白质降解剂(如 PROTAC、分子胶)对目标蛋白(正靶)的降解效率及其对非目标蛋白(脱靶)的影响,为降解剂的作用机制验证、选择性优化、脱靶评估以及效力研究提供关键数据支持,尤其助力难成药靶点降解剂的开发。



平台特点

√核心技术支撑:结合 TMT 多重比较与 DIA 高灵敏度深度覆盖两大技术。其中,TMT多重比较可实现单次实验平行分析多条件,有效提升实验效率、减少系统误差;DIA 高灵敏度深度覆盖则能灵敏检测低丰度蛋白,大幅降低漏靶概率。

√关键量化能力:依托上述技术,可精准量化降解剂对 “正靶” 的降解率,同时清晰评估“脱靶” 效应,为降解剂选择性评价提供直接、可靠的 “硬数据”。

√流程与结果优势:具备标准化实验流程,确保方法可扩展性;且能直接检测蛋白质丰度的实际变化(即功能效应直读),而非依赖间接结合信息,从而更精准、可靠地关联降解剂的最终功能效果。


案例展示

项目简介:针对理性设计的PROTAC分子,在细胞中确定其对靶点的降解效果,及潜在的脱靶蛋白。

数据展示:分别利用免疫印迹和质谱方法对目标蛋白的丰度进行定量分析。



在一次实验中对肿瘤细胞系中5900个蛋白进行定量分析,成功确定PROTAC1(图2)和PROTAC2(图3)的降解蛋白以及其他潜在的脱靶蛋白。



相关文献

※通过系统性筛选激酶组降解性,建立首个激酶靶点可降解性图谱,揭示 228 种激酶可被 PROTAC 降解,为加速降解剂开发提供关键资源库与设计策略。 Mapping the Degradable Kinome Provides a Resource for ExpeditedDegrader Development. Cell. 2020, 183(6):1714-1731.(IF: 42.5)



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