产品系列二:光亲和探针
许多活性小分子化合物,例如生物体代谢物,天然产物和药物分子,都是以非共价的方式和靶点蛋白质发生动态可逆相互作用,当蛋白质在体外研究过程中一旦失活,则会破坏二者之间的结合力。在小分子化合物靶点鉴定,细胞分布成像和蛋白质标记等领域,光亲和标记技术(Photoaffinity labeling, PAL)应用广泛,它是一种共价捕获小分子-生物大分子相互作用的常用方法,在外界紫外光刺激的条件下,化学探针上的光交联基团(分类和特点见下表)能够产生自由基、氮宾或卡宾,从而能够快速共价标记空间上邻近的生物大分子。
| 光交联基团 | 光照波长 | 活性中间体 | 优点 | 缺点 |
|---|---|---|---|---|
| 苯甲酮(Benzophenones) | 350-360 nm | 自由基 |
a) 商业易得; b) 光照波长不会造成生物性损伤 |
a) 化学结构较大; b) 光照时间长 |
| 叠氮苯(Aryl Azides) | <300 nm | 氮宾 |
a) 易合成; b) 化学结构小 |
a) 光照波长较短,可能造成生物大分子损伤; b) 易出现非特异性交联 |
| 双吖丙啶(Diazirines) | 350-380 nm | 卡宾 |
a) 反应速率快; b) 化学结构小; c) 光照波长不会造成生物性损伤 |
a) 合成繁琐; b) 可异构化生成重氮中间体 |
其中,双吖丙啶结构以其生物兼容性强,化学结构小,反应速度快等特点,在小分子光亲和生物正交探针中应用最为广泛,科学家们相继开发了带有不同衍生化官能团(氨基、羧基或碘)的光交联连接子,光交联基团用于捕获生物大分子,生物正交基团(例如炔基)作为报告基团,能够后续偶联荧光素和生物素,用于蛋白质信号检测或富集分离。同时,新型高反应活性的光交联连接子也在持续开发中。
将光交联连接子与活性小分子偶联,即产生具有生物活性的光亲和生物正交探针,相比于传统的生物素基团修饰改造,光交联连接子体积小,对活性小分子结构,细胞穿膜能力等改动均较小,结合长波长紫外光照条件,非常适合在活细胞中直接结合并共价捕获结合蛋白,广泛应用于活性小分子靶点发现,脱靶蛋白鉴定和分布成像。
| 产品货号 | 产品结构 | 产品名称 | 产品用途 | 产品/原药CAS号 |
|---|---|---|---|---|
| 02010029 |
|
2-(3-(But-3-yn-1-yl)-3H-diazirin-3-yl)acetic acid, Diazirine-acid | 光交联连接子,用于化学探针合成 | 2049109-24-0 |
| 02010031 |
|
2-(3-(But-3-yn-1-yl)-3H-diazirin-3-yl)ethan-1-amine, Diazirine-amine | 光交联连接子,用于化学探针合成 | 1450752-97-2 |
| 02010090 |
|
3-(But-3-yn-1-yl)-3-(2-iodoethyl)-3H-diazirine, Diazirine-iodo | 光交联连接子,用于化学探针合成 | 1450754-38-7 |
| 02010095 |
|
3-(2-Bromoethyl)-3-(but-3-yn-1-yl)-3H-diazirine | 光交联连接子,用于化学探针合成 | 2432830-88-9 |
| 02010030 |
|
2-(4-(3-(Trifluoromethyl)-3H-diazirin-3-yl)phenyl)acetic acid,4-((trifluoromethyl)diazirinyl)phenylacetic acid | 光交联连接子,用于化学探针合成 | 148058-40-6 |
| 02010094 |
|
2-(3-Methyl-3H-diazirin-3-yl)ethan-1-amine | 光交联连接子,用于化学探针合成 | 36902-22-4 |
| 02010040 |
|
Celastrol probe, Ce-2 | 雷公藤红素光亲和探针 | 34157-83-0 |
| 02010051 |
|
Kaurenoic acid probe,KA-1 | 异贝壳杉烯酸光亲和探针 | 6730-83-2 |
| 0102E000074 |
|
Arachidonic acid probe | 花生四烯酸光亲和探针 | 506-32-1 |
| 02010152 |
|
Deoxycholic acid probe, CMX-Q-013 | 脱氧胆酸光亲和探针 | 83-44-3 |
| 02010131 |
|
Chol-2 | 胆固醇光亲和探针 | 57-88-5 |
| 02010021 |
|
Betulinic acid probe, BA-Xalkyne | 白桦酸光亲和探针 | 472-15-1 |
| 02010171 |
|
Metformin probe, Met-P1 | 二甲双胍探针 | 657-24-9 |
| 02010048 |
|
Berberine probe, BBR-1 | 小檗碱光亲和探针 | 633-65-8 |
| 0102E000095 |
|
benzoquinoquinoxaline (BQQ) | BQQ光亲和探针 | 207671-99-6 |